玉米苗期的病虫害非常多，常见的有
玉米苗期常见的虫害主要是地老虎，黏虫，蚜虫，蓟马等。
地老虎又叫地蚕，土蚕，切根虫等，苗期常见的是小地老虎和黄地老虎，秋季多雨和早春二，三月份多雨，四月份少雨，对地老虎的发生非常有利，可能大暴发。
黏虫也是一种暴发性的毁灭性害虫，俗称行军虫，夜盗虫等，幼虫在玉米幼叶啃食造成半透明的小条斑。
蚜虫主要是危害玉米的幼叶，造成卷曲。
蓟马也在心叶中危害，造成玉兰心叶的扭曲不展。
玉米出苗后用氯氰菊酯或氯氟氰菊酯加吡虫啉或啶虫脒作叶面喷施，浓度不要太高，取各药剂的最低浓度喷撒洒，以免造成幼苗的中毒。对地老虎的防治最好于傍晚撒施毒土，拌种的玉米虫害发生率低。
玉米苗期的病害主要是病毒病，是玉米粗缩病，矮花叶病的易发期。
玉米粗缩病主要是灰飞虱传播，造成玉米苗的粗缩矮化，暗绿色，有时心叶卷在一起，生长缓慢几乎停滞。
玉米矮花叶病又称花叶条纹病，玉米苗期先从心叶基部出现褪绿条点状花叶，后扩大到全叶，叶失绿变黄，有黄绿相间的条纹。
造成玉米病毒病的罪魁祸首是蚜虫和灰飞虱，及时消灭田间它们能够减轻病害的发生。主要采用吡虫啉和啶虫脒等，或菊酯类农药等。