婴儿腹泻的病因分为两大类：感染性腹泻和非感染性腹泻，感染性腹泻病原常见的有病毒感染（轮状病毒、诺如病毒等）和细菌感染，病毒感染不推荐使用抗生素，主要对症治疗，饮食清淡，止泻药如蒙脱石散和肠道益生菌如小培菲康，口服补液盐防止脱水，奶粉可以换为无乳糖奶粉，细菌性肠炎需要口服抗生素如头孢克肟等。非感染性腹泻的原因常常有母乳因素、菌群失调、乳糖不耐受和过敏性肠炎等，尤其乳糖不耐受和母乳因素比较常见，给宝宝添加乳糖酶，在母乳喂养前添加，宝妈饮食清淡。过敏性肠炎时需要用水解奶粉喂养。