四川在中国历史上不仅仅是两次消亡。至少应该是三次，或者四次。当然，史前发生的事暂且不说，也说不清楚。

第一次是蜀人、巴人进入四川之后。四川适宜居住的主要是四川盆地，而四川盆地本来是有原住民的。但蜀人、巴人是来源于川西高原和长江中游荆湘之地。说明巴蜀先祖来到四川后，四川地区曾经历过全面的换血。但是因为时间太过久远，且未有史料记载，暂且不做讨论。

第二次是秦灭蜀以后。秦灭亡古蜀以后，四川地区为秦所得。秦人大量迁徙至川，而四川地区原有的蜀人、巴人、郪人，甚至僰人都从此销声匿迹，取而代之的是秦人或逆江而上的楚人。巴蜀古人以及古巴蜀文化从此断绝。这应该是有记录以来，四川在中国历史上的第一次消亡。

第三次是元灭宋以后。元灭宋，四川是反抗最激烈的地方，大量川人及川人物资在宋末元初毁于战火。从此富饶的四川地区开始变为人烟稀少的地方，直到明朝末年四川也仅恢复到300余万人口。因此宋元之际四川几乎遭到了灭顶之灾，对四川历史影响极大。元初时四川因人口太少，曾经被并入陕西，与陕西组建为秦蜀行省，后面才分置四川行省。

第四次是明末清初。距离宋元之际仅300多年，四川再次遭遇毁灭之灾。明末清初，张献忠、清军、南明、吴三桂、土匪等各方势力先后在四川地区进行了几十年的角逐，几十年的战乱让四川沦为一片焦土，人烟俱无，十室十空，成为不折不扣的人间地狱。这是古代四川经历的最后一次人事大灾难，此后湖广填川，新四川也是用了几百年时间才得以恢复。